2003年，深度思维科学家第一次对人类基因组进行测序，推出揭示了构成我们生命“蓝图”的法基全部DNA序列。尽管98%的因组基因组不直接编码蛋白质，它们仍深刻作用着基因的人工调控和细胞作用。这些非编码区域曾被视为“垃圾DNA”，智慧A中XM外汇平台受哪里监管但如今被认为可能蕴藏着关键的揭秘生物学秘密，就像是物质基因界的“暗物质”。
今年6月25日，深度思维“深度思维”公司公布，推出他们开发出一款名为AlphaGenome（阿尔法基因组）的法基人工智慧（AI）模型，有望在破译这一“暗物质”上取得突破。因组xm外汇官网入口《自然》杂志报导称，人工这一“从序列到作用”的智慧A中模型能预测DNA中微小变动会对一系列分子流程产生的作用，为解码人类基因调控机制供给了新路径。揭秘
说明DNA序列的“一体化”软件
深度思维公司在2020年推出的“阿尔法折叠2”（AlphaFold 2），成功破解了一个困扰科学界数十年的难题：如何根据蛋白质的氨基酸序列，精确预测其三维架构。这一突破不仅变更了架构生物学研究方法，也促进了新药研发的进程。
相比之下，要理解DNA序列的作用则更加复杂，因为它不像蛋白质那样拥有一个确定的xm外汇平台官网“正确答案”。这些作用主要体现在DNA对基因陈述的调控上，比如决定基因什么时候开启或终止，在哪些细胞中发挥作用，以及以何种强度陈述。
如果说蛋白质架构预测是在拼出“零件”的立体模型，那么DNA作用预测就是要理解说明书中每一个符号、注释、开关命令甚至“暗物质”区域的真正含义。其中涉及的数据层级更复杂、关联更普遍，且同一个DNA片段可能在不并且间、不同细胞类别中扮演不同角色，因此建模难度远高于蛋白质。
几十年来，生物学家尝试用各种计算软件来揭示DNA复杂而隐秘的调控机制，但这些模型往往聚焦于单一作用。科学家们渴望一种用于说明DNA序列的“一体化”软件，于是，“阿尔法基因组”应运而生。
据美国趣味工程网站报导称，与以往需在“序列长度”与“预测精度”之间取舍的模型不同，“阿尔法基因组”实现了二者兼得。它既能捕捉长程基因组上下文数据，又能供给碱基层面的精准预测，拓展了疾病生物学、罕见变异研究、合成DNA设计等领域的研究视野。
一次可应对百万个碱基对
据深度思维官网介绍，该模型一次可应对多达100万个碱基对，并预测数千种分子属性，包括基因陈述、剪接模式、蛋白质结合位点和染色质可及性，涵盖多种不同类别的细胞。这是第一次有AI平台能联合建模如此普遍的调控特征。
“阿尔法基因组”训练所用的数据集来自多个曝光的超大规模数据资源。令人惊讶的是，训练一个完整模型仅需4小时，且所需计算资源仅为前代模型的一半。在26项基准测试中，其有24项表现优于或持平于专用模型。
新模型的一大看点是其变异评分平台，能高效对比突变前后的DNA序列，并跨多种生物通路评估其作用。
“阿尔法基因组”还具备剪接位点建模作用，这是第一次有模型能够预测与囊性纤维化、脊髓性肌萎缩等疾病有关的RNA剪接异常。
在合成生物学领域，“阿尔法基因组”可用于设计特定的调控序列，例如仅在神经细胞中激活某些基因，而在肌肉细胞中保持沉默。并且，它也有望用于研究生物效应强烈的罕见遗传变异，如引发孟德尔遗传病的突变。
在一项验证中，研究人员将“阿尔法基因组”软件于先前研究中识别出的某种白血病有关突变。结论，该模型精确预测出，某些非编码区变异会间接激活附近的TAL1致癌基因，这一机制正是T细胞急性淋巴细胞白血病中已知的致病流程。
模型尚不适用于个体诊断
尽管“阿尔法基因组”的表现令人瞩目，但深度思维团队表示，该平台目前仍存在很多限制。它并未设计用于个体基因组解读，也无法像23andMe或临床基因检查那样预测疾病风险或祖源数据。也就是说，该模型不适用于个体诊断或医疗决策。
“阿尔法基因组”目前的训练数据仅限于人类和小鼠，尚未涵盖其他物种，其跨物种适应性尚待验证。并且，它在识别调控元件与远距离靶基因（距离超过10万个碱基）之间关系方面的水平仍较弱，也无法完全建模细胞在不同情形、不同机构中的动态调控机制。
美国冷泉港实验室计算生物学家彼得·库表示：“这些模型往往是在一个固定条件下训练的，但现实中的细胞是动态的，蛋白质水平、DNA化学修饰、转录情形等都会随时间和生态变动，这些变动会显著作用同一段DNA序列的行为。”因此，将来模型需要引入更多“多模态”“多时间尺度”因素，才能更真实地模拟生物流程。
